شناخت تنوع ژنتیکی و طبقه بندی ذخایر توارثی (ژرم پلاسم) در پیش برد اهداف به نژادی و مدیریت حفظ ذخایر ژنتیکی گیاهان دارای نقش اساسی می باشد. از این رو، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی 20 ژنوتیپ رز با استفاده از 6 نشانگر CDDP و 20 نشانگر RAPD صورت گرفت. برای تعیین تشابه بین ژنوتیپ های رز از ضریب تشابه جاکارد استفاده گردید و گروه بندی ژنوتیپ ها به روش اتصال همسایگی (NJ) انجام شد. دامنه ضریب تشابه ژنتیکی بین ژنوتیپ ها 04/0 تا 77/0 برای نشانگر CDDP و برای نشانگر RAPD بین 05/0 تا 79/0 به دست آمد. درصد چند شکلی نشانگرهای CDDP و نشانگر RAPD، 100 درصد برآورد گردید. تجزیه خوشه اینشانگرهای CDDPو RAPD ژنوتیپ ‏ها را به سه گروه تقسیم- بندی کرد. مطالعه حاضر نشان داد نشانگرCDDP به خوبی ژنوتیپ های رز را از هم تفکیک نمودند و این اولین گزارش آنالیز تنوع ژنتیکی رز با استفاده از نشانگر مولکولی که براساس ناحیه DNA هدف گذاری-شده (CDDP) در مقایسه با نشانگر RAPD، است. نشانگر CDDP به عنوان سیستم مولکولی جدید برای ارزیابی ژرم پلاسم رز معرفی شد.